Para poder anular una factura de compra debés tener en cuenta si la misma ya fue facturada o no, es decir, si se registró un modo de pago en la dicha factura. Para comprobar esto debés seguir los siguientes pasos.

1. Ingresá a Menú → Compras → Manejo integral proveedores.
2. En la ventana utilizá los filtros en la parte superior para identificar al proveedor cuya factura necesitás anular. En la seccion izquierda están las facturas registradas y, en el lado derecho, si cuentan con una forma de cobro vinculada. 
3. En caso de no tener una forma de cobro registrada, seleccioná la factura en cuestión y presioná el botón Anular. Una vez realizado, solo queda confirmar su anulación para finalizar.

Si tiene una forma de cobro registrada, debés anularla. Para ello, seguí los pasos a continuación.

1. Seleccioná la forma de cobro en la misma ventana (del lado derecho) y con doble clic o enter accederás a su detalle.
2. Elegí el cobro del apartado valores entregados y seleccioná la opcion Anular. 
3. Una vez anulada la forma de cobro, podrás utilizar el botón de Anular para la factura como indica el comienzo del instructivo.